Nanobind CBB Big DNA Kit slouží k rychlé extrakci velmi dlouhých fragmentů DNA z buněčných kultur, kultivovaných bakterií (G+ a G-) a plné krve. Izolace využívá magnetické disky s nanostrukturovaným křemičitým povrchem, které chrání DNA před mechanickým namáháním a umožňují šetrné promývání. Výsledkem je nejdelší a nejčistší izolovaná DNA vhodná pro long-read sekvenování a optické mapování.

Izolace pomocí Nanobind disků byla důkladně validována pro použití na platformách PacBio Sequel I/II, Oxford Nanopore Minion/GridION/Promethion a 10X Genomics Chromium. Izolovanou DNA je možné použít i pro jakékoliv další aplikace, které vyžadují vysoce kvalitní vstupní DNA s minimální fragmentací.

Pro izolaci lze využít dva základní protokoly. První slouží k izolaci HMW DNA o velikosti 50–300+ kb, druhý k izolaci UHMW DNA o velikosti 50 kb–1+ Mb). Nanobind generuje konzistentně sekvenační délku N50 30–50 kb a při použití protokolu pro izolaci UHMW DNA lze dosáhnout i N50 přes 150 kb. Typické výtěžky jsou 5–100+ μg na extrakci v závislosti na typu vzorku. Nanobind kit lze kombinovat i s Short Read Eliminator Kit pro odstranění krátkých fragmentů DNA a dále tak zvýšit průměrnou délku čtení.

Balení obsahuje:

• proteináza K
• RNáza A
• CLE3 eluční pufr CLE3
• BL3 vazebný pufr
• promývací pufr CW1
• promývací pufr CW2
• eluční pufr EB
• 20x magnetický Nanobind disk

Pro izolaci DNA z G+ bakterií je potřeba použít navíc lysozym a STET pufr, které nejsou součástí balení.