NanoBind Tissue Big DNA Kit slouží k rychlé extrakci velmi dlouhých fragmentů DNA z tkání rozličných živočichů, jako jsou savci, ryby, ptáci, měkkýši nebo korýši. Izolace využívá magnetické disky s nanostrukturovaným křemičitým povrchem, které chrání DNA před mechanickým namáháním a umožňují šetrné promývání. Výsledkem je nejdelší a nejčistší izolovaná DNA vhodná pro long-read sekvenování a optické mapování. Kit byl již použit k sekvenování všeho od prasat po nahožábré plže, kraby královské, obří krevety, zebřičky a antarktické ryby. Na stránkách výrobce jsou dostupné aplikační listy pro různé druhy a můžete tak vyjít z již existujících a ověřených protokolů.

Izolace pomocí Nanobind disků byla důkladně validována pro použití na platformách PacBio Sequel I/II, Oxford Nanopore Minion/GridION/Promethion a 10X Genomics Chromium. Izolovanou DNA je možné použít i pro jakékoliv další aplikace, které vyžadují vysoce kvalitní vstupní DNA s minimální fragmentací.

Pro izolaci lze využít dva základní protokoly. První slouží k izolaci HMW DNA o velikosti 50–300+ kb, druhý k izolaci UHMW DNA o velikosti 50 kb–1+ Mb). Nanobind generuje konzistentně sekvenační délku N50 20–60 kb z téměř jakéhokoli typu vzorku na jakékoli platformě. Typické výtěžky jsou 5 ug–100+ ug na extrakci v závislosti na typu tkáně a vstupním materiálu. Vzorky hmyzích tkání, hlístic a hub nejsou zatím oficiálně podporovány. Na vybrané druhy je kit použitelný při použití dodatečných pufrů, které nejsou součástí balení. Pro více informací nás kontaktujte.

Kit obsahuje:

• proteináza K
• RNáza A
• CT pufr
• SB pufr
• pufr pro digesci CLE3
• pufr pro lyzi/vazbu BL3
• promývací pufr CW1
• promývací pufr CW2
• eluční pufr EB
• 20x Magnetický Nanobind disk