Seminář Promega a JPT Technologies – Účinné nástroje pro MS proteomiku

Zveme Vás na seminář, který tentokrát organizujeme ve spolupráci s německou společností JPT Technologies. Tentokrát se zaměříme na MS proteomiku a představíme Vám účinné nástroje pro přípravu a kvantifikaci vzorků vyvinutých společnostmi Promega a JPT Technologies. Seminář bude rozdělen do dvou částí a bude veden v angličtině.

Část 1. – Nástroje pro robustní, spolehlivou a přesnou analýzu proteinů pomocí hmotnostní spektrometrie (Promega)

Příprava proteinových vzorků pro analýzu pomocí hmotnostní spektrometrie je komplexním procesem s mnoha nástrahami. V této části semináře Vás seznámíme s řešeními běžných problémů při přípravě vzorků a představíme Vám nástroje a reagencie od společnosti Promega, které Vám pomohou dosáhnout robustní, spolehlivou a přesnou charakterizaci proteinů a proteomu pomocí hmotnostní spektrometrie. Zaměříme se zejména na to, jak zlepšit digesci proteinů a charakterizaci bioterapeutických proteinů pomocí peptidového mapování.

V této části se mimo jiné dozvíte:

• Jak dosáhnout efektivní extrakce, solubilizace a digesce
• Jak se vyhnout nechtěným vedlejším účinkům, jako je nespecifické štěpení, neenzymatické modifikace proteinů a nadměrná autoproteolýza protein
• Jak zvládnout celou přípravu vzorku pro analýzu během 1 hodiny
• Jak zvýšit pokrytí sekvence protein pomocí nových proteáz

Přednášející:

Vojtěch Ledvina, Ph.D. – aplikační specialista, East Port Praha

Část 2. Jednoduchá kvantifikace proteinů pomocí SpikeTides peptidů (JPT Technologies)

Proteomika se zabývá studiem buněčného obsahu v rozdílných časech pomocí identifikace a kvantifikace proteinů. Použití LC-MS/MS tento proces významně ulehčilo. Běžně jsou vzorky obsahující relevantní proteiny nejprve naštěpeny na peptidy a následně analyzovány pomocí LC-MS/MS, což supluje měření hladin celých proteinů. Pro zvýšení přesnosti detekce a umožnění kvantifikace mohou být do vzorku přidány chemicky syntetizované peptidy značené stabilními izotopy. Technologie syntézy peptidů společnosti JPT umožňuje velmi rychlou a levnou výrobu referenčních peptidů a peptidových poolů značených lehkým nebo těžkým izotopem, která zajišťuje snadnější profilování celého proteomu pomocí MS. Referenční peptidy SpikeTides™ a peptidové pooly SpikeMix™ umožňují robustní, multiplexní identifikaci a relativní kvantifikaci hladin exprese proteinů.

Naše SpikeTides TQL s patentovanou značkou QTag, malou chemickou značkou připojenou ke každému peptidu, umožňují :robustní a reprodukovatelnou kvantifikaci pomocí HPLC-UV nebo HPLC-MS a UV bez nutnosti používat tradiční těžkopádné a nákladné kvantifikační metody, jako je AAA. Značka QTag se snadno uvolňuje při digesci trypsinem a neinterferuje s následným měřením. Metoda je velmi přesná a byla ověřena v mnoha recenzovaných publikacích.

V této části semináře Vám představíme:

• Syntézu peptidů a jednotlivé kvalitativní úrovně
• Lidský atlas proteomu
• Rozličné formáty peptidů pro cílenou a funkční proteomiku
• Metody pro kvantifikaci a Qtag peptidy jako alternativu pro absolutní kvantifikaci peptide
• Kity pro standardizaci
• Reference pro standardizaci PTM a retenčních časů
• Příklady aplikací jako je např. imunopeptidomika

Přednášející:

Michael Drosch, PhD – JPT Peptide Technologies

Harmonogram:

9:30-10:00    Registrace 
10:00-11:00   Nástroje pro robustní, spolehlivou a přesnou analýzu proteinů pomocí hmotnostní spektrometrie (Promega)
11:00-12:00   Jednoduchá kvantifikace proteinů pomocí SpikeTides peptidů (JPT Technologies)

Pro koho je webinář určený?

Seminář je přístupný všem zájemcům nezávisle na jejich zaměření a věku a vhodný je i pro vysokoškolské studenty. Pro účast je nutná registrace. Seminář bude veden v angličtině.